Menurut jurucakap skuad Australia, keputusan itu dibuat untuk Pallister berehat bagi 4x200 renang bebas beganti-ganti.
Saringan untuk acara 1,500m bermula pada pagi Selasa di La Defense Arena.
Pallister meraih gangsa dalam 1,500m gaya bebas pada Kejohanan Dunia 2022 di Budapest serta merupakan ahli pasukan gaya bebas 4x200m Australia yang memenangi gelaran dunia di Fukuoka tahun lepas.
Dia turut menyertai acara gaya bebas 800m di Paris yang bermula Jumaat.
Sebelum ini, perenang Britain Adam Peaty juga disahkan positif COVID-19 pada Isnin lalu, beberapa jam selepas terlepas pingat emas ketiga berturut-turut dalam acara 100m kuak dada lelaki.
Beberapa pemain polo air wanita Australia turut diuji positif COVID-19 pada hari-hari menjelang upacara pembukaan, memaksa mereka untuk mengasingkan diri daripada ahli pasukan yang lain.